Esta Escuela está orientada al establecimiento de programas de estudio que vinculan los estudios teológicos con otras disciplinas del saber, a la vez, de  ir aperturando espacios a carreras en disciplinas diferentes de la Teología.

Siendo actualmente la UNELA, una universidad con carreras fundamentalmente teológicas, la Escuela de Ciencias Aplicadas y Estudios Interdisciplinarios ha sido creada  para albergar carreras y programas de carácter interdisciplinario pero con base teológica.

Por ejemplo, ofrecemos un progrma en Estudios Transculturales, y se han iniciado los trámites respectivos para ofrecerla como Bachillerato en estudios Transculturales.

Otro  ejemplo de Estudios Interdisciplinarios es el campo de la Misiología en donde se utiliza tanto las ciencias sociales, y la antropología como la misma teología. También están aquellas carreras y programas netamente no teológicas pero que por su tamaño, no les es posible todavía ubicarse en una facultad o Escuela propia; estas pueden incluirse en el  campo de las Ciencias Naturales como en  las Ciencias Sociales.